Jde to řešit bez lispu docela snadno - klasická razítka. 
Ono není vůbec od věci zkontrolovat při razítkování, jestli jsou výkresy všechny, atd.

Záleží na způsobu tisku, kompletace, velikosti paré, počtu současně kompletovaných akcí, ...
Za určitých okolností může být vytisknuté číslo paré ne ušetření času a práce, ale naopak ztížení kompletace a zdroj zmatků. Možná i zvýšení porcenta zkažených papírů.

Kdysi jsem nějaké řešení na toto téma hledal, došel jsem k závěru, že by to nebylo k ničemu. Narazítkovat čísla na paré je to nejmenší zdržení při expedici projektu.

Otázkou také je, zda vůbec číslovat (všechna) paré potřebujete. Není to jen zvyk?

Tím postupným Publish myslíte asi tisknout postupně požadovaný počet výtisků a ne pomocí zadání počtu kopií, že?
Jinak bez toho post procesu se obávám, že to moc běžně nepůjde. Ty watermarky se dají různě nastavovat, ale např. v našem případě nevidím nějakou možnost, že by se tam nastavilo něco jako počítadlo výtisků jednoho jobu.