Dobrý den, jak můžu ve výkresu "obarvit" referenční výkres aniž bych ovlivnil zdroj?

když si výkres podložíte jako xref, tak se Vám ve vypisu hladin objeví hladiny tohoto navázaného výkresu. Tam si nastavete barva dle potřeby, ve zdrojovém souboru se Vám nezmění.
 
Doporučuji provést kontrolu zdrojového xref souboru, aby tam byly všechny hladiny nastavena s barvou dle hlad
 
A v nastaveních ACADu si v možnostech ještě zkontrolujte na záložce >otevřít a uložit< zatržení volby >zachovat změny v hladinách xref<Machacek2009-09-10 16:09:05

nebo také viz CAD tip # 5755 (odkaz dole v příbuzných tipech)

Ano, to poslední (tedy nastavení [VAR]VISRETAIN[/VAR]) je podstatné. Jinak jde o standardní nastavování vlastností hladin.