Máte nejspíš špatně rozvržený postup práce a kreslíte ucho dřív než hrnek (ať je to co je to). Jinak by jste měl možnost v náčrtu promítnout stávající geometrii a vyvarovat se takovému průniku objektů.

Řešení je opravdu víc.

1) Opravit náčrty tak aby vám jednotlivé části takto nepronikali do sebe.

2) Vytvořit další náčrt s promítnutím kruhové geometrie a rotací odečíst ty výstupky.

3) V Inventoru máte v kartě Model, sekci Povrch a tam je ikonka Odstranit plochu. Kde máte i zmiňovanou možnost léčit. Ale u této funkce pozor, odstaní plochy pouze tam kde to je možné dosáhnout pomocí inventorových funkcí. Jinak Vám zdeformuje model podle toho jak máte nastavené plochy a ostatní náčrty. Ale někdy pro urychlení práce, je to neocenitelná funkce.